脑透明隔囊肿一般不会自行消失。脑透明隔囊肿多为先天性发育异常或后天因素导致的结构改变，通常需要医学干预才能缓解或消除。
脑透明隔囊肿是位于两侧侧脑室之间的透明隔内形成的囊性病变，多数情况下生长缓慢且无明显症状。这类囊肿的形成与胚胎期神经管发育异常、脑脊液循环障碍等因素有关，其囊壁由胶质细胞构成，内部充满脑脊液样液体。由于囊壁结构稳定且缺乏自发吸收机制，囊肿通常不会随时间推移而缩小或消失。部分患者可能因囊肿体积较小或位置特殊，长期无临床症状而被偶然发现，但这并不意味着囊肿已自行消退。
极少数情况下，婴幼儿期的脑透明隔囊肿可能随着脑组织发育出现形态学改变，但这种情况属于生理性结构调整而非真正的囊肿消失。若囊肿因外伤、感染等继发因素导致囊壁破裂，可能造成囊肿暂时性缩小，但后续仍需医学评估以防止复发或并发症。
建议确诊脑透明隔囊肿的患者定期进行头颅影像学复查，若出现头痛、视力障碍、癫痫发作等神经系统症状，需及时就医。治疗方案需根据囊肿大小、位置及临床症状综合评估，可能包括神经外科手术引
